Olex2結構精修時信息無法寫入CIF的解決方案
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有時候在使用Olex2進行結構精修的時候,在Olex2操作界面填入的信息無法寫入CIF文件。案例如下。
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晶體數據所在文件夾文件情況如圖1所示:

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Olex2中Report>>Source Files中也正確讀取晶體參數文件cif_od(理學單晶衍射儀記錄儀器信息、晶胞參數等信息的文件),如圖2所示。

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在Report>>Crystal中填入了晶體描述(plate),以及絕對結構確定方法(Anomalous dispersion),如圖3所示。

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然而在調用PLATON進行結構驗證(Structure Validation)時,卻出現了如圖4所示的AB類警報。

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打開CIF文件,發(fā)現很多信息的參數缺失,全都是問號,如圖5–6所示。


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對于這種情況,可以點擊如圖7所示的Merge CIF按鈕。

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點擊Merge CIF按鈕后,Olex2界面左下角提示“All 21 conflicts have been resolved”,并且自動打開CIF,可以看的,CIF中那些原來是問號的條目均已填上相應的信息,如圖8–10所示。

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此時關閉CIF文件。
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千萬不要精修!
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千萬不要精修!
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千萬不要精修!
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因為精修就會產生新的CIF文件,并把已填好信息的CIF文件給覆蓋掉。
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關掉CIF文件后,直接調用PLATON進行結構驗證,則之前出現的AB類警報已消失,如圖11所示。

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如果還需要進行精修,那么在精修全部完成后,點擊Merge CIF按鈕,點完后就不要再精修了,點完Merge CIF按鈕產生的CIF文件就是最新的已經解決問題的最終CIF文件。
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