金眼鯛的分類一直以來確實都很迷，有許多學術界人士都對它們有獨到的見解，對于分類也各執(zhí)一詞

如下，隨便找了幾個差別較大的分類方法（不一定具有代表性）

當然，上面三個圖片的分類基礎肯定是演化關系

確實還會有其他的分類方法，其中不妨會有一些奇葩的分類法。曾經還將須鳂目歸為金眼鯛目下的一科，但后來通過種種分析，至少通過觀察鰭條數(shù)這種外觀上的差異就能分辨出須鳂目應不屬于金眼鯛目（金眼鯛目背鰭鰭條多為10-20；而須鳂則可多達44），并且它也沒有金眼鯛目特有的哈氏感覺管，左右鰓膜不連接等，這樣就可以判斷它們并不屬于金眼鯛目，甚至可以單獨分為須鳂類。

1中，有時燧鯛目也會作為金眼鯛目下的燧鯛亞目，它們均為體長而側扁，口大、前位，尾長和尾鰭長均較長，具粘液腔，背鰭單一，在金眼鯛目中屬于形態(tài)特征較為相似的。3中，直接就將金眼鯛科歸為燧鯛科內，但是我認為這種做法并不合理，如此過于激進，無異于忽視它們之間的差異。

有時又會把巨鼻魚科并入仿鯨魚科，由于這些魚類并不常見，所以關于它們的文獻少之又少，但仍有一定的理由反對此觀點，因為巨鼻魚科下幾乎所有魚類均為圓形尾，而仿鯨魚科幾乎都是叉形尾。并且雌性巨鼻魚的中篩骨更加膨大，尾長更長，吻長更短，作為科這一分類單位來講，我認為將其合并還是過于牽強

然而1中將鳂科獨分到金眼鯛亞類，因為它們從演化關系和歷程來看，確實比我們想象中和鱸形亞類的關系稍近一些，相對和金眼鯛亞類的關系稍遠一些，所以可以被單獨分為金眼鯛亞類。

現(xiàn)如今大鱗鯛科是屬于奇鯛（亞）目還是金眼鯛（亞）目也是一個具有不小爭議的話題，有研究報告稱它們與金眼鯛科的演化關系和親緣關系更近，但是也有人認為大鱗鯛背鰭單一，口大無齒等，因此屬于奇鯛。

當下的主流分類方法見下圖

主要是奇鯛目中合并了許多科，但是我個人覺得這種分類方法并不是非常完美，畢竟有些科之間的差別是顯而易見的。不過從物種演化上來看，這確實是符合其中趨勢的。優(yōu)缺點并存，所以我覺得近年來還將會有一些小的變動

文章中融入了一些個人見解，若有錯誤希望各位大佬撥冗指正