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SCI作圖進階版GraphPad繪圖技能2.0:IC50的log轉(zhuǎn)化技巧

2023-06-24 09:31 作者:爾云間meta分析  | 我要投稿


今天給大家分享一個,用GraphPad繪制IC50濃度梯度等距排列的技巧。


首先展示一篇Nature上的樣圖。與直接在橫坐標上輸入0.001, 0.01, 0.1, 1, 10, 100不同的是,X軸上實現(xiàn)濃度梯度等距排列,需要先進行l(wèi)og轉(zhuǎn)化。

(PMID: 25186731

老規(guī)矩,咱們還是“四步走”!


STEP 1

首選我們需要創(chuàng)建一個XY的表格形式,選擇輸入XY軸數(shù)據(jù)。

STEP 2

輸入log10轉(zhuǎn)化后數(shù)據(jù)。以0.001, 0.01, 0.1, 1, 10, 100為例,log10轉(zhuǎn)化后對應(yīng)-3, -2, -1, 0, 1, 2,因此我們可以在X軸上對應(yīng)著輸入轉(zhuǎn)化后的數(shù)值。

STEP 3

選擇繪制線圖,Y軸起始大小設(shè)為X軸的最小值(這里是-3)。

STEP 4

設(shè)置X軸格式,因為X軸中的數(shù)字是經(jīng)過log10計算的,因此在Regularly spaced ticks-Number format里選擇Antilog,即可獲得X軸的濃度梯度值。


到這里,一個濃度梯度等距排列的折線圖就完成啦。當然,我們還可以繼續(xù)設(shè)置次刻度標記,來豐富X軸中的內(nèi)容。


注意,次刻度標記也要勾選log哦!

整個操作還是非常簡單便捷的。為了使大家更好地理解,我們以個性化的數(shù)據(jù)為例:首先將X軸(濃度)的數(shù)據(jù)進行l(wèi)og10轉(zhuǎn)換并輸入到對應(yīng)的表格中,Y軸不變。然后對橫坐標進行antilog設(shè)置后,就可以生成濃度梯度等距排列的效果了。


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