各位看官大家好！空間代謝組Q&A又和大家見面啦！上一期，我們介紹了空間代謝組學的工作流程及樣本準備小技巧（點擊閱讀）。這一期，我們將為大家繼續(xù)解答數(shù)據(jù)處理中的常見小問題。

Q1：深度空間代謝組學如何進行數(shù)據(jù)處理方式是什么？

深度空間代謝組學的原始數(shù)據(jù)通過SCILSTM?Lab軟件處理。SCILSTM?Lab是由Bruker公司針對空間代謝組學數(shù)據(jù)特點而開發(fā)的商業(yè)化質(zhì)譜成像分析軟件。該軟件很好地解決了傳統(tǒng)數(shù)據(jù)處理中，涉及空間和高維代謝組信息整合時，難以準確展現(xiàn)真實分子層面的變化的痛點。目前該軟件被廣泛使用，堪稱分析利器。

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Q2：SCILSTM?Lab的優(yōu)勢是什么？

1. ?內(nèi)部邏輯穩(wěn)定，集成完整質(zhì)譜數(shù)據(jù)標準化與成像分析功能，輸出數(shù)據(jù)可追溯；

2. ?集成下一代機器學習集成算法，支持臨床大隊列分析比較，多樣本/多區(qū)域/3D成像整合處理；

3. ?高效的譜圖解析功能，可實現(xiàn)深度挖掘關(guān)鍵代謝物信息；

4. ?可視化操作，數(shù)據(jù)隨時可調(diào)，快速交付。

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Q3：深度空間代謝組分析是如何進行代謝物定性的？

傳統(tǒng)空間代謝組學定性指標有兩種，分別是MS1(一級質(zhì)譜)和MS2（二級質(zhì)譜）。在新一代空間代謝組學技術(shù)中，利用離子淌度捕集裝置，針對離子橫截面積不同的特點進行分離，形成第三個定性指標CCS值。深度空間代謝組學基于tims-TOF flex MALDI 2開發(fā)，可以根據(jù)實驗需求，結(jié)合中科本地標準品數(shù)據(jù)庫以及Bruker商業(yè)代謝物數(shù)據(jù)，實現(xiàn)上述三種指標的定性分析，大幅提升代謝物鑒定準確性。

Q4：深度空間代謝組學數(shù)據(jù)分析結(jié)果示例

關(guān)于每種分析具體功能和應(yīng)用方向，我們會在下一期空間代謝組學Q&A中詳細介紹討論，敬請各位期待~