優(yōu)質(zhì)有機肥堆肥的發(fā)酵過程一般需要45-60天。 這是因為植物病原菌、蟲卵、雜草種子等有害微生物會在堆肥初期的升溫階段和高溫階段被殺死，但微生物在這個過程中的主要功能是新陳代謝和繁殖，僅少量的代謝產(chǎn)物，這些代謝產(chǎn)物不穩(wěn)定，不易被植物吸收。

　　在后期的降溫過程中，微生物會對有機物進行腐殖化，在此過程中產(chǎn)生大量有利于植物生長和吸收的代謝產(chǎn)物。 這個過程需要 45-60 天。

　　通過這個過程堆肥可以達到三個目的，一是無害化; 二是謙卑; 三是產(chǎn)生大量的微生物代謝產(chǎn)物，如各種抗生素和蛋白質(zhì)物質(zhì)。

有機堆肥的發(fā)酵過程可以簡單分為以下四個階段

1.發(fā)熱階段

　　在堆肥初期，堆肥中的微生物以嗜溫好氧為主，最常見的有非孢子菌、孢子菌和霉菌。 它們啟動堆肥的發(fā)酵過程，劇烈分解易分解的有機物質(zhì)(如單糖、淀粉、蛋白質(zhì)等)，這是發(fā)熱階段，或中溫階段。

2.高溫階段

　　隨著溫度的升高，嗜熱微生物逐漸取代嗜溫微生物并發(fā)揮主導(dǎo)作用，溫度不斷升高，一般在幾天內(nèi)達到50℃以上，進入高溫階段。 在高溫階段，嗜熱放線菌和嗜熱真菌成為主要物種。 它們強烈分解堆肥中復(fù)雜的有機物(如纖維素、半纖維素、果膠物質(zhì)等)，積聚熱量，堆肥溫度升至60-70℃，甚至高達80℃。 隨即，大部分嗜熱微生物也大量死亡或進入休眠狀態(tài)(20天以上)，對加速堆肥分解起到了重要作用。 堆肥不當(dāng)?shù)亩逊手挥卸虝r間的高溫，或根本達不到高溫，所以分解很慢，半年或更長時間都不會達到半分解狀態(tài)。

3.降溫階段

　　當(dāng)高溫階段持續(xù)一定時間后，大部分纖維素、半纖維素、果膠物質(zhì)已經(jīng)分解，留下難以分解的復(fù)雜成分(如木質(zhì)素)和新形成的腐殖質(zhì)，微生物的活性減弱, 溫度逐漸升高。 衰退。 當(dāng)溫度降至40℃以下時，嗜溫微生物再次成為優(yōu)勢種。

　　如果冷卻階段來得早，說明堆肥條件不理想，植物物質(zhì)分解不充分。 此時可翻堆，將堆料混合均勻，產(chǎn)生二次熱能升溫，促進堆肥成熟。

4.腐熟保肥階段

　　堆肥分解后，體積縮小，堆肥溫度下降到略高于氣溫。 此時應(yīng)將堆肥壓實，使其處于厭氧狀態(tài)，減弱有機質(zhì)礦化作用，以利于肥料保存。

　　堆肥實際上是一種廢物穩(wěn)定形式，但它需要特殊的濕度、通風(fēng)條件和微生物才能產(chǎn)生合適的溫度。 研究表明，在一定溫度下加熱一段時間，可以消滅病原體、雜草種子。 通常在60-70°C(濕熱)的溫度下，加熱5-10分鐘。 能破壞非孢子菌的活性和孢子菌的非休眠體。 熱滅菌可采用70℃加熱30分鐘，消除污泥中的病原體。 然而，在較低的溫度(50-60°C)下，一些致病菌可以被滅活長達 60 天。 因此，在堆肥過程中需要將溫度保持在60℃以上一段時間。 合理堆肥后，殘留有機物分解率低，比較穩(wěn)定，易被植物吸收。 堆肥后氣味可大大減少。

　　堆肥有機質(zhì)礦化可為作物和微生物提供可利用的養(yǎng)分，為微生物活動提供能量，為堆肥有機質(zhì)的腐殖化準備基礎(chǔ)原料。 當(dāng)堆肥以好氧微生物活動為主時，有機質(zhì)迅速礦化生成較多的二氧化碳、水等養(yǎng)分，分解速度快而徹底，釋放出大量熱能; 當(dāng)堆肥以厭氧微生物活動為主時，有機物分解速度慢，而且往往不完全，釋放的熱能小。 其分解產(chǎn)物除植物養(yǎng)分外，易積累有機酸和CH4、H2S、PH3、H2等還原性物質(zhì)。 當(dāng)達到一定程度時，對作物生長不利。 甚至有害。 因此，發(fā)酵過程中堆肥的翻動也是為了轉(zhuǎn)換微生物活動的類型，以消除有害物質(zhì)。

　　各種生物體和微生物在堆肥過程中的死亡、更替和物質(zhì)形態(tài)轉(zhuǎn)化是同時進行的。 無論是從熱力學(xué)、生物學(xué)還是物質(zhì)轉(zhuǎn)化的角度來看，這些反應(yīng)都不可能在這么短的幾天或十幾天的時間內(nèi)完成，這就是為什么即使在以下前提下堆肥仍然需要45-60天溫度、濕度、水分、微生物等各種條件都得到很好的控制。