一年底盤點

又到了一年一度的年終盤點了，公眾號（B站開始較晚）從2021年的5月4日至今，已然過去了607天，公眾號的關(guān)注人數(shù)也從一開始的0升到了如今1734，公眾號發(fā)的推文也累計到了106篇（竟然每隔一個星期一篇，沒想到自己更新的還可以）。在此過程中也認識了各位讀者，相同領(lǐng)域的公眾號。我也從一個懵懵懂懂的學生走向了職場，成為了一名合格的科研民工。

雖然，公眾號（B站）粉絲的數(shù)量遠比不上那些大V，閱讀量也不是特別的多（從幾千到幾百不等）。但是，能與公眾號的號的1734位讀者分享筆者對于這個世界的所看，所想以及各種技術(shù)貼，這種意義遠遠大于粉絲的數(shù)量和閱讀數(shù)。能夠?qū)⒆约旱乃鶎W通過公眾號傳播出去，能夠?qū)⒆约簩τ诩夹g(shù)發(fā)展的理解分享給大家，這才是經(jīng)營公眾號（B站）的最大幸事。雖然，筆者對于技術(shù)的解讀與發(fā)展并不一定是最專業(yè)的，最準確的，但是，這些觀點都是來源筆者本人的親身理解（全宇宙獨一份）。雖然，這些內(nèi)容僅僅也像天邊的流星一樣，不會在任何的生命里留下痕跡，但是假如哪一天有人抬頭望向星空的時候，能夠駐足一秒，何嘗不是筆者創(chuàng)辦公眾號的意義所在呢。如果，即使是微小的可能，能夠幫助部分讀者在數(shù)據(jù)分析以及未來的職業(yè)選擇中發(fā)揮一點點的作用，對于本公眾號（B站）而言，也已經(jīng)是彌足珍貴了。

雖然，能夠通過公眾號（B站）認識到大家，是一種幸事，但是，距離這一年目標仍然是有缺憾的。想想這一年，科研方面似乎沒啥成果，眾多項目也僅僅是推進積累中，距離發(fā)表仍有一段距離要走。工作方面，又到一年一度的求職季。文章數(shù)較少，找工作仍然十分艱難，想要找到一份誠心如意的工作更是難上加難?？纯瓷磉叺呐笥讶Γ蠹叶际窃诒镏鴦诺陌l(fā)各種大文章，申請各種大項目，而自己，目前才處于初見眉目的狀態(tài)，距離一名合格的獨立的科研工作者還有很長的一段時間要走。

那么接下來的一年，需要的就是繼續(xù)努力，多發(fā)文章（兩到三篇），多申請項目（申請國基）。

PS:既然是年終盤點，那么還是可以把去年一整年自己覺得還不錯的推文整理一下供大家取用。
二推文盤點

今年的推文涉及到形式比較多樣化，所以簡單的做一個歸類，希望能夠幫助大家快速做到技術(shù)檢索（大家可以從公眾號的推文直接點擊文字，即可跳轉(zhuǎn)到對應(yīng)的推文，有沒有很貼心）。

2.1 流程技術(shù)貼

轉(zhuǎn)錄組分析<六>之問題解讀（無root權(quán)限）

如何使用最小的存儲空間跑完轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析（超500G的測序數(shù)據(jù)）

GWAS分析<一>之原理介紹

GWAS分析<二>之數(shù)據(jù)質(zhì)控的原理

GWAS分析<三>之數(shù)據(jù)質(zhì)控

GWAS分析<四>之數(shù)據(jù)質(zhì)控最終章

GWAS分析<五>之群體結(jié)構(gòu)分析一

2.2 自研軟件貼

可視化繪圖軟件Multi-omics Visual之韋恩圖繪制

可視化繪圖軟件Multi-omics Visual之組合圖繪制

可視化繪圖軟件Multi-omics Visual之熱圖繪制

可視化繪圖軟件Multi-omics Visual之PCA圖3D繪制

可視化繪圖軟件Multi-omics Visual之3D熱圖繪制

2.3 輪子（各種安裝包）技術(shù)貼

R包介紹：使用ggalluvial繪制共線性圖（alluvial）

R包介紹：使用circlize包繪制和弦圖

python包介紹：使用seaborn繪制密度圖（kdeplot函數(shù)）

如何不污染服務(wù)器的python的包環(huán)境

精美網(wǎng)絡(luò)圖繪制《一》之python包: Networkx----補充

2.4 算法系列

算法其實還是有意思的，后面應(yīng)該會考慮持續(xù)更新這一系列。這樣既能鍛煉自己，也能傳播知識，何樂而不為？

算法淺談之KNN算法

2.5 書籍推薦系列

其實，越是當今這個技術(shù)快速更新的時代，越是需要以書為準，盡力提升自己

生信入門書籍推薦系列一

生信入門書籍推薦系列2

2.6 雜談技術(shù)貼

這部分內(nèi)容的話其實主要也是自己在工作中遇到的一些需求與需要解決的問題，正好整理成相應(yīng)的技術(shù)貼與大家分享交流

docker初探

docker鏡像之a(chǎn)lphafold運用

docker鏡像之RoseTTAFold運用

在pypi上快速發(fā)布你的python包

在pypi上快速發(fā)布你的python包-修正版

docker版ubtuntu的使用

3060Ti驅(qū)動的安裝（文末附工作鏈接）

GPU版docker之多用戶使用

Github超超超超簡單教程！??！

Github超超超超簡單教程?。?！--------之FAQ

一次失敗的服務(wù)器搭建體驗

Tensorflow使用指南

2.7 人工智能與編程

其實，從AlphaCode更新開始，我就意識到編程的低階部分很有可能會被快速取代，后續(xù)的Copilot和ChatGPT無疑更是加重了這一趨勢。因此，對于想要進入生信流程的各位讀者而言，我覺得算法可能才是我們目前最最最重要的護城河之一了。

編程自動化之Copilot

在VScode上使用Copilot輔助python編程

編程自動化之AlphaCode

ChatGPT: 會打破生信程序員的飯碗嗎？

與ChatGPT的科研對話

2.8 放松一下

愿大家都是勞逸結(jié)合

閑聊工作之效率提升

科研真相

圖一樂：如何使用機器學習成為具有藝術(shù)天分的畫家

數(shù)據(jù)分析之經(jīng)驗教訓

數(shù)據(jù)分析之經(jīng)驗教訓二

一年一度考研季

求職季

科研休假之喘口氣

三 慣例小結(jié)

過去的一年，有幸認識大家。新的一年，祝愿大家學習進步，工作順利，文章一直發(fā)。也祝自己在新的一年，完成既定的博后任務(wù)，找到一份誠心如意的工作。

本公眾號開發(fā)的相關(guān)軟件，Multi-omics Hammer軟件和Multi-omics Visual軟件歡迎大家使用。文末是本公眾號在其他平臺的賬戶，也歡迎大家關(guān)注并多提意見。

Multi-omics Hammer軟件下載地址：

https://github.com/wangjun258/Multi-omics-Hammer

Multi-omics Visual軟件下載地址：https://github.com/wangjun258/Multi_omics_Visual/releases/tag/Multi_omics_Visual_v1.03

PS：因為本軟件是用python腳本撰寫，調(diào)用了部分依賴包，用戶首次使用需要安裝python以及對應(yīng)的包，安裝之后便可永久使用。

本公眾號開發(fā)的相關(guān)軟件，Multi-omics Hammer軟件和Multi-omics Visual軟件歡迎大家使用。文末是本公眾號在其他平臺的賬戶，也歡迎大家關(guān)注并多提意見。

簡書：WJ的生信小院

公眾號：生信小院

博客園：生信小院

最后，也歡迎各位大佬能夠在本平臺上：1傳播和講解自己發(fā)表的論文；2：發(fā)表對某一科研領(lǐng)域的看法；3：想要達成的合作或者相應(yīng)的招聘信息；4：展示自己以尋找博后工作或者博士就讀的機會;5:博導(dǎo)提供博后工作或者博士攻讀機會，都可以后臺給筆者留言。希望本平臺在進行生信知識分享的同時，能夠成為生信分析者的交流平臺，能夠?qū)崿F(xiàn)相應(yīng)的利益互補和雙贏（不一定能實現(xiàn)，但是夢想總得是有的吧）。

另外，怎么說呢，投幣也可，不強求，但奢求。

四 每日一圖（這一次不用Stable-diffuse創(chuàng)作，而是來源于生活）

縱然美景就在眼前，仍需等待迷霧散去，方能一睹風采