爾云間? 一個(gè)專門做科研的團(tuán)隊(duì)

原創(chuàng)?小果?生信果

小伙伴們大家好啊，想必大家經(jīng)常遇到網(wǎng)絡(luò)圖吧，它們多種多樣顏色，大小，樣式，五花八門，很是讓人頭疼，今天小果就帶大家來看看網(wǎng)絡(luò)圖吧。

網(wǎng)絡(luò)圖是自定義性比較強(qiáng)的圖，一般使用Cytoscape進(jìn)行構(gòu)建和美化，因?yàn)槭亲远x的，所以需要結(jié)合圖下面的標(biāo)題和注釋來看。

比如說上面這張圖，點(diǎn)的大小表示連線度，顏色表示上下調(diào)，黃色上調(diào)，藍(lán)色下調(diào)，線條表示相互作用，線條越多表示基因在網(wǎng)絡(luò)中越重要。

這是子網(wǎng)絡(luò)，和總網(wǎng)絡(luò)一樣，點(diǎn)越大越關(guān)鍵。

許多網(wǎng)絡(luò)圖下面都有這么一張圖，這是韋恩分析的圖，作用與韋恩圖類似，也是起一個(gè)取交集的作用，通過對(duì)網(wǎng)絡(luò)的拓?fù)湫再|(zhì)取交集來篩選關(guān)鍵基因。比如說其中的Degree是連線數(shù)，其余數(shù)據(jù)也都是反應(yīng)基因節(jié)點(diǎn)關(guān)鍵程度的。

上面的都是蛋白互作網(wǎng)絡(luò)圖，接下來看一下靶基因和miRNA的互作圖。

這上面紅色三角表示miRNA，圓形表示基因，顏色表示上下調(diào)，線條就表示基因和miRNA之間的關(guān)系。

類似的還有轉(zhuǎn)錄因子網(wǎng)絡(luò)，上圖中黃色三角是轉(zhuǎn)錄因子，紅色橢圓是靶基因，箭頭由轉(zhuǎn)錄因子指向靶基因，表示轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控靶基因。

總而言之，網(wǎng)絡(luò)圖并不復(fù)雜，只要仔細(xì)看一下圖片的標(biāo)題和注釋，圖片信息基本就都掌握了。好了，今天的主要內(nèi)容就是這樣了，小伙伴們有什么問題歡迎來和小果分享討論喲。

推薦閱讀

GO的概念及用R做簡單的富集分析

柱狀圖-腫瘤某一指標(biāo)的比較和GSVA結(jié)果展示

小果教你三分鐘看懂多條線共存的ROC圖的R語言畫法

一步到位？R代碼構(gòu)建列線圖

又準(zhǔn)又好，R語言繪制列線圖和校準(zhǔn)圖