微生物肥料的主要作用是改善土壤環(huán)境，促進(jìn)植物根系的發(fā)育。只要能知道植物根系的重要性，就能知道生物有機(jī)肥中含有的許多功能微生物在生長(zhǎng)繁殖過程中會(huì)產(chǎn)生大量的次生代謝產(chǎn)物，能促進(jìn)土壤團(tuán)粒結(jié)構(gòu)的形成。

　　團(tuán)聚體結(jié)構(gòu)的形成可使土壤松軟，增強(qiáng)水肥保持能力，使水、氣、熱更加協(xié)調(diào)，減少土壤壓實(shí)，有利于水肥保持、通氣和根系發(fā)育，為作物提供舒適的生長(zhǎng)環(huán)境。

　　當(dāng)然，考慮到微生物菌肥的主要成分是生物活性菌，在使用過程中存在以下缺點(diǎn):

　　1.見殺菌劑就死亡，不能與不同殺菌劑進(jìn)行混合系統(tǒng)使用，防治根腐病、根癌等土傳病害;

　　2.看紫外線對(duì)死亡的影響，秋季基肥為紫外線質(zhì)量最好的太陽階段，紫外線能殺死肥料里面的微生物菌體;

　　3.與化肥混合使用時(shí)，要注意化肥用量不能太大。高濃度化學(xué)物質(zhì)對(duì)細(xì)菌肥料中的微生物有毒害作用，尤其是不與碳酸氫銨等堿性肥料和硝酸鈉等生理性堿性肥料混合使用時(shí)。

　　此外，細(xì)菌肥料中的細(xì)菌也取決于有機(jī)物的存活條件。當(dāng)土壤中有足夠的有機(jī)質(zhì)或腐殖質(zhì)時(shí)，可以被微生物利用，使土壤微生物快速繁殖，激活養(yǎng)分元素。土壤微生物的主要功能是產(chǎn)生各種酶，分解各種養(yǎng)分，產(chǎn)生各種酸和二氧化碳，為農(nóng)作物提供更多的養(yǎng)分。而微生物細(xì)菌要想生存和繁殖，土壤中必須有足夠的有機(jī)質(zhì)。所以我們提倡使用有機(jī)肥料和細(xì)菌肥料配合使用!