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文獻晶體數(shù)據(jù)改進示例11(金剛烷基無序)

2023-10-18 14:04 作者:DJ_Tokyo  | 我要投稿

案例來源:J. Org. Chem.?2023,?88, 4345?4351.

DOI:10.1021/acs.joc.2c02944

CCDC:2190301

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圖形用戶界面:Olex2[1](版本:Olex2-1.5

精修程序:SHELXL[2](版本:SHELXL-2019/2

CIF文件下載:CCDC[3]官網(wǎng)

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根據(jù)CCDC號從CCDC官網(wǎng)下到2190301.cif文件,用Olex2打開并提取其hkl和res文件查看,如圖1所示,其金剛烷基的碳原子橢球形變嚴(yán)重,周圍的Q峰形成另一個金剛烷基構(gòu)象。

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▲圖1 CCDC 2190301數(shù)據(jù)概覽


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對該基團做二重?zé)o序處理,以SAME指令和SIMU指令對其進行限制,最終結(jié)果如圖2所示。

▲圖2 CCDC 2190301重新處理結(jié)果


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視頻操作演示請參閱:https://www.bilibili.com/video/BV1LC4y1d782

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結(jié)語

對于明顯存在的無序,應(yīng)當(dāng)進行適當(dāng)處理,此舉不僅可改善數(shù)據(jù)指標(biāo),還可避免被審稿人打回重新處理而增加時間成本。

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參考文獻

[1]?Dolomanov, O. V.; Bourhis, L. J.; Gildea, R. J.; Howard, J. A. K.; Puschmann, H.?OLEX2: A complete structure solution, refinement and analysis program. J. Appl. Cryst.?2009,?42, 339–341.

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