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SSR 和 ISSR 標記有什么區(qū)別

2023-06-07 09:03 作者:biofount科研試劑  | 我要投稿

什么是 SSR 標記

SSR 標記是分析具有 1-6 個核苷酸重復(fù)序列的 DNA 區(qū)域的分子標記。因此,SSR標記是一種微衛(wèi)星DNA,是VNTR的一種。SSR標記分析的主要重要性是遺傳結(jié)構(gòu)。SSR 標志物分析共顯性特征。因此,SSR 標志物可以識別雜合位點。此外,這些標記允許鑒定多等位基因性質(zhì),同時鑒定多個等位基因,可重復(fù)性,高多態(tài)性和基因組的均勻分布。

圖1:STR標記

此外,SSR標記的核苷酸序列放大了串聯(lián)核苷酸重復(fù)。微衛(wèi)星是具有重復(fù)核苷酸序列的DNA基序。它們在基因組中出現(xiàn)數(shù)千次。兩種類型的微衛(wèi)星DNA是短串聯(lián)重復(fù)序列(STR)和簡單序列重復(fù)序列(SSR)。

什么是 ISSR 標志物

ISSR標記是另一種包含顯性DNA序列的DNA標記。重復(fù)序列長約100-300個核苷酸。ISSR標記通過使用引物擴增,引物退火到基因組中兩個相鄰微衛(wèi)星區(qū)域的互補序列。因此,它允許在單個實驗中分析多個位點。然而,ISSR標記出現(xiàn)在兩個微衛(wèi)星重復(fù)序列之間。因此,ISSR標記允許擴增基因組中的隨機DNA序列。

圖 2:SSR 標記

由于ISSR標記是顯性DNA序列,因此只能檢查DNA序列的存在與否。 DNA標記對于鑒定品種的遺傳變異很重要。

結(jié)論

簡而言之,SSR和ISSR標記是兩種對群體表征很重要的遺傳標記。SSR標記出現(xiàn)在微衛(wèi)星中,它們有1-6個核苷酸重復(fù)序列。他們通過擴增串聯(lián)重復(fù)來識別雜合位點。另一方面,ISSR標記是發(fā)生在微衛(wèi)星DNA之間的基因組DNA序列。它們是100-300個核苷酸的較長重復(fù)序列。ISSR標志物允許在單個實驗中分析多個位點。此外,它們擴增基因組的隨機序列。因此,SSR 和 ISSR 標記之間的主要區(qū)別在于重復(fù)的類型。


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