Python的分子模擬動(dòng)態(tài)促進(jìn)DF Theory理論對二進(jìn)制硬盤系統(tǒng)的適用性
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原文出處:拓端數(shù)據(jù)部落公眾號(hào)
作者:Lawrence Xi
這是一個(gè)偏學(xué)術(shù)的項(xiàng)目。流體力學(xué)界對過冷液體(supercooled liquid)的認(rèn)知還不完善,我的項(xiàng)目利用Python的分子模擬,通過搭建一個(gè)binary hard disk system并對系統(tǒng)進(jìn)行壓縮模擬來驗(yàn)證Dynamic Facilitation Theory是否適用于我搭建的分子模型。
DF Theory包含以下理論推測
系統(tǒng)激發(fā)態(tài)密度與系統(tǒng)壓力成log關(guān)系:

系統(tǒng)的弛豫時(shí)間和系統(tǒng)壓力成如下關(guān)系:


?來源:項(xiàng)目PPT
我在Python內(nèi)搭建如上binary hard disk模型,?并壓縮系統(tǒng)至不同的密度來模擬過冷液體。壓縮完成之后在此運(yùn)行系統(tǒng)來模擬過冷液體常規(guī)布朗運(yùn)動(dòng)。在此期間,收集每一個(gè)粒子的實(shí)時(shí)坐標(biāo)(x,y)并做如下計(jì)算:
辨別系統(tǒng)的激發(fā)態(tài)密度

驗(yàn)證系統(tǒng)激發(fā)態(tài)密度和系統(tǒng)壓力是否成log關(guān)系

計(jì)算系統(tǒng)的弛豫時(shí)間(relaxation time)

驗(yàn)證系統(tǒng)弛豫時(shí)間和系統(tǒng)壓力的關(guān)系

結(jié)果?
通過收集大量系統(tǒng)模擬分子坐標(biāo)的實(shí)時(shí)數(shù)據(jù)以及對其進(jìn)行延伸計(jì)算,我們可以發(fā)現(xiàn)DF Theory是適用于binary hard disk system。?
激發(fā)識(shí)別
用指示函數(shù)量化激發(fā)的總密度?

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??來源:項(xiàng)目PPT
Boltzmann關(guān)系:線性關(guān)系與查找能量標(biāo)度KA

???來源:項(xiàng)目PPT

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關(guān)于作者

在此對Lawrence Xi對本文所作的貢獻(xiàn)表示誠摯感謝,他畢業(yè)于加州大學(xué)圣塔芭芭拉分校,專長化學(xué)工程和統(tǒng)計(jì)。興趣技能點(diǎn)廣泛,對數(shù)據(jù)分析,品牌營銷,客戶策略,以及industry-related科研感興趣,精通Microsoft Office,Python,Matlab,Mathematica等學(xué)術(shù)軟件,尤其Python 數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗(yàn)充分。

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