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質(zhì)譜檢測組蛋白修飾

2023-02-03 09:46 作者:百泰派克生物科技  | 我要投稿

質(zhì)譜是對組蛋白翻譯后修飾進(jìn)行全局、無偏、定量分析的強(qiáng)大工具,可以對組蛋白翻譯后修飾進(jìn)行定性、定量和位點(diǎn)鑒定。百泰派克生物科技提供基于質(zhì)譜的組蛋白翻譯后修飾分析服務(wù)。

組蛋白修飾檢測

核小體是染色質(zhì)的最小結(jié)構(gòu)單位,由組蛋白八聚體包裹有147個堿基對的DNA組成。組蛋白功能由廣泛的翻譯后修飾(post-translational modification,PTM)介導(dǎo),這些修飾對于核完整性至關(guān)重要,因?yàn)樗鼈冋{(diào)節(jié)染色質(zhì)結(jié)構(gòu)并募集參與基因調(diào)控、DNA修復(fù)和染色體濃縮的酶。采用基于抗體的技術(shù)(如western blot)可以表征組蛋白翻譯后修飾的豐度,但這些方法的通量較低且不能識別未知的PTM。質(zhì)譜是對組蛋白翻譯后修飾進(jìn)行全局、無偏、定量分析的強(qiáng)大工具。質(zhì)譜方法可對單個樣品中的60多個修飾狀態(tài)進(jìn)行定量,遠(yuǎn)遠(yuǎn)超出了傳統(tǒng)蛋白質(zhì)印跡(western blot)的能力。因此,基于質(zhì)譜的組蛋白分析已成為了解遺傳和環(huán)境因素如何影響表觀遺傳狀態(tài)的一種越來越流行的工具。

質(zhì)譜檢測組蛋白修飾

質(zhì)譜檢測組蛋白修飾

質(zhì)譜檢測組蛋白修飾常常采用自下而上的策略,將完整的組蛋白用酶消化成短肽。由于組蛋白富含精氨酸和賴氨酸殘基,胰蛋白酶消化會導(dǎo)致產(chǎn)生的肽段太小,因此,消化前可通過丙酸酐衍生化組蛋白未修飾和單甲基化的賴氨酸殘基,以防止胰蛋白酶裂解賴氨酸。在液相色譜與質(zhì)譜聯(lián)用(LC-MS)時,產(chǎn)生適當(dāng)大小的肽,以實(shí)現(xiàn)最佳離子化效果。組蛋白修飾質(zhì)譜檢測不僅可以對修飾進(jìn)行定性和定量,還可以進(jìn)行組蛋白修飾位點(diǎn)鑒定。


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