鐵死亡實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)沒思路?看完這篇9分+文獻(xiàn)解讀就有了!
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鐵死亡(ferroptosis)是一種鐵依賴的、脂質(zhì)過氧化物累積的新型細(xì)胞死亡方式,與腫瘤的發(fā)生、發(fā)展和耐藥密切相關(guān)。自從鐵死亡被發(fā)現(xiàn)以來,就以一己之力掀起研究狂潮,至今熱度不減,儼然成為醫(yī)學(xué)科研領(lǐng)域熱門的研究方向,也是近些年國自然基金熱點(diǎn)資助項(xiàng)目。
今天,小薇跟大家分享一篇“9+”鐵死亡文獻(xiàn)思路,手把手教你鐵死亡實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)。
文獻(xiàn)信息
文章題目:Cetuximab promotes RSL3-induced ferroptosis by suppressing the Nrf2/HO-1 signalling pathway in KRAS mutant colorectal cancer(在KRAS突變型結(jié)直腸癌中,西妥昔單抗通過抑制Nrf2/HO-1信號(hào)通路促進(jìn)RSL3誘導(dǎo)的鐵死亡)
雜志:Cell Death and Disease (IF: 9.865)
研究設(shè)計(jì)
1. 研究西妥昔單抗對RSL3對KRAS突變CRC細(xì)胞的細(xì)胞毒作用的影響
使用4個(gè)KRAS突變的CRC細(xì)胞株(HCT116、DLD-1、LOVO和SW480)分別用RSL3單獨(dú)或聯(lián)合西妥昔單抗處理24小時(shí),研究藥物對細(xì)胞存活率的影響。通過存活率結(jié)果,后續(xù)實(shí)驗(yàn)選擇HCT116和DLD-1細(xì)胞。研究RSL3、西妥昔單抗和二者聯(lián)合處理24小時(shí)后對兩種細(xì)胞存活率、細(xì)胞形態(tài)改變、集落形成能力等的影響。
2. 研究西妥昔單抗對KRAS突變CRC細(xì)胞中RSL3誘導(dǎo)的鐵死亡的影響
為了研究RSL3和西妥昔單抗是否會(huì)促進(jìn)鐵死亡,在KRAS突變體HCT116和DLD-1細(xì)胞中評估了鐵死亡相關(guān)指標(biāo),即脂質(zhì)活性氧(ROS)積累、丙二醛(MDA)水平,細(xì)胞內(nèi)的鐵水平等。而且,細(xì)胞內(nèi)加入鐵死亡抑制劑Fer-1、凋亡抑制劑Z-VAD-FMK、壞死抑制劑necrostatin-1或自噬抑制劑3-MA,研究哪種抑制劑可以抑制RSL3和西妥昔單抗處理對HCT116和DLD-1細(xì)胞生長的抑制。
3. 研究RSL3和西妥昔單抗聯(lián)合處理對KRAS突變CRC細(xì)胞中的Nrf2/HO-1軸的影響
Keap1是細(xì)胞對氧化應(yīng)激反應(yīng)的主要調(diào)節(jié)因子。氧化應(yīng)激后,Keap1與Nrf2分離,導(dǎo)致Nrf2積累,核易位,激活靶基因HO-1的轉(zhuǎn)錄。因此,本研究首先研究了RSL3和西妥昔單抗聯(lián)合處理對Keap1、Nrf2、HO-1等蛋白的影響;然后敲除Nrf2,評估Nrf2表達(dá)對西妥昔單抗和RSL3處理KRAS突變CRC細(xì)胞的存活率以及鐵死亡相關(guān)指標(biāo)的影響。
4. 研究西妥昔單抗是否通過激活p38 MAPK調(diào)節(jié)Nrf2/HO-1軸
為了研究p38 MAPK在Nrf2/HO-1表達(dá)中的作用,評估了西妥昔單抗和SB202190 (p38的特異性抑制劑)對HCT116和DLD-1細(xì)胞中p38活性、Nrf2和HO-1表達(dá)的影響;研究RSL3、西妥昔單抗和SB202190處理對細(xì)胞存活率的影響。然后,在兩種細(xì)胞中過表達(dá)Nrf2或HO-1,研究過表達(dá)Nrf2或HO-1后對西妥昔單抗和RSL3聯(lián)合處理的細(xì)胞的存活率的影響。
5. 體內(nèi)試驗(yàn)研究西妥昔單抗在體內(nèi)是否能促進(jìn)RSL3誘導(dǎo)的鐵死亡
構(gòu)建異種移植裸鼠模型,探討西妥昔單抗在體內(nèi)是否能促進(jìn)RSL3誘導(dǎo)的鐵死亡。研究RSL3、西妥昔單抗及二者聯(lián)合處理對腫瘤重量、腫瘤大小、腫瘤體積、體重;體內(nèi)MDA水平;以及Nrf2、HO-1和Keap1蛋白水平的影響。
主要結(jié)果
1. 西妥昔單抗增強(qiáng)RSL3處理對KRAS突變CRC細(xì)胞的細(xì)胞毒性作用
研究發(fā)現(xiàn),西妥昔單抗處理增強(qiáng)了RSL3對HCT116和DLD-1細(xì)胞的細(xì)胞毒作用(圖1A,B)。與RSL3或西妥昔單抗處理相比,RSL3和西妥昔單抗聯(lián)合處理顯著抑制了細(xì)胞增殖(圖1C)。提示西妥昔單抗處理通過顯著抑制細(xì)胞活力、抑制細(xì)胞增殖,增強(qiáng)RSL3對KRAS突變CRC細(xì)胞系的細(xì)胞毒作用。
圖1 西妥昔單抗增強(qiáng)RSL3對KRAS突變CRC細(xì)胞的細(xì)胞毒作用
2. 西妥昔單抗增強(qiáng)KRAS突變CRC細(xì)胞中RSL3誘導(dǎo)的鐵死亡
采用脂質(zhì)過氧化探針C11-BODIPY581/591檢測細(xì)胞內(nèi)脂質(zhì)ROS水平,發(fā)現(xiàn)RSL3和西妥昔單抗聯(lián)合處理后,脂質(zhì)ROS積累顯著增加(圖2A)、MDA水平顯著升高(圖2B)。西妥昔單抗對HCT116或DLD-1細(xì)胞系的脂質(zhì)ROS積累和MDA水平?jīng)]有影響,但增強(qiáng)了RSL3誘導(dǎo)的脂質(zhì)ROS水平和MDA水平的增加(圖2B)。而且,與RSL3單獨(dú)處理相比,RSL3和西妥昔單抗聯(lián)合處理的細(xì)胞發(fā)出更強(qiáng)的橙色熒光(圖2C)。此外,RSL3和西妥昔單抗處理增加了對HCT116和DLD-1細(xì)胞生長的抑制,這種效果被鐵死亡抑制劑Fer-1逆轉(zhuǎn)(圖2D)。這些結(jié)果表明,西妥昔單抗能增強(qiáng)KRAS突變CRC細(xì)胞系中RSL3誘導(dǎo)的鐵死亡。
圖2西妥昔單抗治療可增強(qiáng)KRAS突變CRC細(xì)胞中RSL3誘導(dǎo)的鐵死亡
3. RSL3和西妥昔單抗聯(lián)合處理可抑制KRAS突變CRC細(xì)胞中的Nrf2/HO-1軸
Western blot分析顯示,RSL3和西妥昔單抗處理后,Keap1表達(dá)增加,抑制Nrf2/HO-1信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)(圖3A)。在HCT116和DLD-1細(xì)胞中,siRNA轉(zhuǎn)染48 h可降低Nrf2及其下游靶點(diǎn)HO-1的表達(dá)。與RSL3組相比,RSL3處理的轉(zhuǎn)染組中Nrf2和HO-1水平降低(圖3B)。轉(zhuǎn)染靶向Nrf2的siRNA可以提高HCT116和DLD-1細(xì)胞對RSL3的敏感性(圖3C)。而且,Nrf2敲低提高了RSL3誘導(dǎo)的MDA水平(圖3D)、細(xì)胞內(nèi)脂質(zhì)ROS水平(圖3E)和細(xì)胞內(nèi)鐵積累(圖3F)。這些結(jié)果表明,RSL3和西妥昔單抗聯(lián)合處理可抑制KRAS突變CRC細(xì)胞中的Nrf2/HO-1信號(hào)。
圖3 RSL3和西妥昔單抗聯(lián)合處理可抑制KRAS突變CRC細(xì)胞中的Nrf2/HO-1軸
4. 西妥昔單抗激活p38 MAPK并調(diào)節(jié)Nrf2/HO-1軸
西妥昔單抗或SB202190處理的細(xì)胞中p38蛋白水平與對照組無差異。西妥昔單抗顯著提高p-p38水平,但當(dāng)西妥昔單抗與SB202190聯(lián)合處理時(shí),這種作用被消除(圖4A)。而且,西妥昔單抗處理降低了Nrf2和HO-1的表達(dá),而SB202190降低了西妥昔單抗介導(dǎo)的Nrf2和HO-1的抑制(圖4A)。此外,RSL3和西妥昔單抗誘導(dǎo)的HCT116和DLD-1細(xì)胞的死亡被SB202190部分挽救(圖4B)。而且,Nrf2過表達(dá)或HO-1過表達(dá)逆轉(zhuǎn)了西妥昔單抗和RSL3聯(lián)合處理對CRC細(xì)胞的存活率的抑制(圖4D-F)。此外,t-BHQ處理激活Nrf2或hemin處理激活HO-1部分逆轉(zhuǎn)了RSL3和西妥昔單抗處理對HCT116和DLD-1細(xì)胞的生長抑制(圖4G, H)。這些結(jié)果表明p38 MAPK參與調(diào)控Nrf2和HO-1的表達(dá),西妥昔單抗可以通過p38 MAPK的激活抑制Nrf2/HO-1通路。
圖4 西妥昔單抗激活p38 MAPK并調(diào)節(jié)Nrf2/HO-1軸
5. 在異種移植裸鼠模型中,西妥昔單抗通過抑制KRAS突變CRC細(xì)胞中的Nrf2/HO-1軸來增強(qiáng)RSL3誘導(dǎo)的鐵死亡
在DLD-1異種移植裸鼠模型中,RSL3單獨(dú)和西妥昔單抗和RSL3聯(lián)合治療均可導(dǎo)致腫瘤大小的減小,并且在兩種藥物聯(lián)合治療組中腫瘤大小的減小幅度最大(圖5B-D)。對照組和處理組的體重和每日攝食量沒有顯著變化(圖5E)。然后我們測試西妥昔單抗和RSL3聯(lián)合治療是否能在體內(nèi)調(diào)節(jié)脂質(zhì)過氧化。值得注意的是,聯(lián)合組MDA濃度水平顯著提高(圖5F)。Western blot結(jié)果顯示, RSL3和西妥昔單抗共同處理后,Nrf2和HO-1的相對水平降低,keap1的表達(dá)相對增加(圖6A)。免疫組化染色同樣證實(shí)、RSL3和西妥昔單抗共同處理后,Ki67、Nrf2和HO-1低表達(dá),keap1高表達(dá)(圖6B)。這些體內(nèi)結(jié)果證實(shí),西妥昔單抗通過抑制Nrf2/HO-1活化來增強(qiáng)RSL3誘導(dǎo)的鐵死亡。
圖5 西妥昔單抗在體內(nèi)增強(qiáng)了RSL3和RSL3誘導(dǎo)的ferroptosis的抑制作用
圖6 西妥昔單抗通過抑制Nrf2/HO-1軸在體內(nèi)增強(qiáng)RSL3誘導(dǎo)的鐵死亡
以上就是本研究的主要內(nèi)容啦,研究邏輯比較清晰,實(shí)驗(yàn)方法比較常規(guī),易復(fù)現(xiàn)。希望這個(gè)研究思路能夠給你帶來一些靈感,說不定還能適當(dāng)?shù)倪\(yùn)用到標(biāo)書設(shè)計(jì)中呢,如果覺得這個(gè)思路對你有所幫助,請轉(zhuǎn)發(fā)點(diǎn)贊哦。
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