PLAT002 Type_2 Report number of atom sites with distance/angle restraints

This ALERT reports the number of atomic sites that are flagged as distance or angle restrained (D-Flag)

此警告報(bào)告標(biāo)記為距離或角度受限制的原子位置的數(shù)目(D標(biāo)記)

(http://journals.iucr.org/services/cif/checking/PLAT002.html)

警告原因：精修中使用了DFIX、DANG等距離限制命令，可以在CIF文件中_atom_site_refinement_flags_posn上讀出，該位上是D則表示被限制。

解決策略：一般無(wú)需解決，限制命令有合理解釋即可。去掉一些非必要的限制可以消除。

PLAT003 Type_2 Report number of non-H atoms with Uiso or Uij restraints

This ALERT reports the number of non-H atoms that are flagged as handled with Uiso or Uij restraints (U-Flag)

此警告報(bào)告標(biāo)記為已用Uiso或Uij約束處理的非氫原子數(shù)目(U標(biāo)記)

(http://journals.iucr.org/services/cif/checking/PLAT003.html)

警告原因：精修中使用了ISOR、SIMU、DELU等溫度因子限制命令，可以在cif文件中_atom_site_refinement_flags_adp上讀出，該位上是U則表示被限制。

解決策略：一般無(wú)需解決，限制命令有合理解釋即可。去掉一些非必要的限制可以消除。

PLAT004 Type_5 Report Dimensionality of polymer

This ALERT reports on polymeric networks and their dimensionality as found in the crystal structure.

Note: Polymeric structures can be legitimate or due to an erroneous structure analysis.

此警告報(bào)告在晶體結(jié)構(gòu)中發(fā)現(xiàn)的聚合物網(wǎng)絡(luò)及其尺寸。

注意：在高分子結(jié)構(gòu)中是合理的，也可能是由與結(jié)構(gòu)分析錯(cuò)誤導(dǎo)致的。

(http://journals.iucr.org/services/cif/checking/PLAT004.html)

警告原因：結(jié)構(gòu)中存在多維結(jié)構(gòu)。

解決策略：一般無(wú)需解決，有合理解釋即可。需要注意檢查是否有不正確的成鍵。

PLAT005 Type_5 Check for refinement instruction file

No embedded 'refinement details' records were found in the CIF. Acta Cryst. requires the inclusion of the last shelxl.res file (in case of a SHELXL or XL refinement or similar for non-SHELXL refinement programs) in the CIF, embedded between records with semicolons in position 1, preceded by an '_iucr_refine_instructions_details' record.

Note: SHELXL20xy will automatically include the final .res as an embedded comment with the dataname '_shelx_res_file'.

CIF中找不到嵌入的“精修細(xì)節(jié)”記錄。Acta Cryst.要求CIF中包含最后一個(gè)shelxl.res文件(當(dāng)使用SHELXL或XL精修程序時(shí)，對(duì)于非SHELXL精修程序，則要求類(lèi)似的文件)，該文件嵌入在位置1中帶有分號(hào)的記錄之間，前面是“_iucr_refine_instructions_details”記錄。

注意：SHELXL 20xy會(huì)自動(dòng)以數(shù)據(jù)名“_shelx_res_file”將最后的res作為嵌入注釋包含在CIF中。

(http://journals.iucr.org/services/cif/checking/PLAT005.html)

例：PLAT005_ALERT_5_G No _iucr_refine_instructions_details in CIF .... ?

警告原因：CIF文件中缺少res文件。

解決策略：將res文件內(nèi)容加入“_iucr_refine_instructions_details”項(xiàng)后，或使用ShelXL2014及以上版本進(jìn)行精修可以自動(dòng)將res文件加入到CIF文件中。

PLAT006 Type_5 Check for Extinction parameter refinement

This ALERT reports the refinement of an extinction parameter.

SHELXL corrects Fobs values in the FCF for Extinction. JANA not.

此警告報(bào)告消光參數(shù)的精修。

SHELXL會(huì)糾正FCF中的Fobs值以進(jìn)行消光，JANA則不會(huì)。

(http://journals.iucr.org/services/cif/checking/PLAT006.html)

警告原因：精修中采用了消光精修(EXTI)。

解決策略：一般無(wú)需解決，有合理解釋即可。需要注意檢查消光系數(shù)是否有意義，即值遠(yuǎn)大于誤差。

PLAT007 Type_5 Report on unrefined D-H atoms

It is standard practice to refine Hydrogen atoms on hetero atoms as proof of their correct assignment.

標(biāo)準(zhǔn)實(shí)踐是在雜原子上精修氫原子，以證明其指認(rèn)正確。

(http://journals.iucr.org/services/cif/checking/PLAT007.html)

例：PLAT 007_ALERT_5_G Number of Unrefined Donor-H Atoms

警告原因：有氫鍵供體原子進(jìn)行了限制性精修。

解決策略：去掉AFIX命令，將供體原子上的氫坐標(biāo)照自由變量精修。