智能計算生物大科學問題
我在“海量基因組與智能生物計算”視頻中簡述了多序列比對能夠用來尋找未知生物大分子相互作用的原理,因此在有足夠基因組數(shù)據(jù)時一定可以構建對應的基因組功能單元相互作用網絡。這個方向仍在萌芽中,據(jù)我所知就我自己在吵吵,希望未來會有越來越多的人加入。
一旦有能力解讀任一物種的基因組功能單元相互作用網絡,物種分類將不再尷尬,合成生物學設計將成為小朋友的積木游戲。物種相互作用(尤其是我們感興趣的病原體-宿主)將變成動態(tài)網絡相互作用分析,這將會是又一個激動人心新研究領域,集圖/網絡分析與物理過程描述為一體。
這些在基因組功能單元網絡層次的新理解和未來分子水平操控的新技術結合將會誕生很多新的研究領域和模式,以前幾年甚至幾十年發(fā)現(xiàn)一個新分子新功能激動不已的情景將會是珍貴的記憶。發(fā)展新算法新技術才是真正的研究,買儀器買軟件重復寫報告的無趣模式很快將被終結。
需要思考也特別有趣的問題是海量基因組多序列比對除了發(fā)現(xiàn)基因組編碼的生物大分子相互作用還可以拿來做什么?有沒有可能跳過多序列比對直接構建智能算法提取海量基因組中億萬年進化的珍貴記錄?
年輕的朋友們,在海量基因組中讀懂自然和進化將是生物大航海時代,是發(fā)現(xiàn)的沃土,是樂趣的海洋。別再卑微地匍匐在sci論文前面焦慮了!
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