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[BioLadder云平臺] 你想要的韋恩圖可以這樣畫!

2021-12-29 11:19 作者:青蓮百奧  | 我要投稿

大家好!我是BioLadder生物信息在線可視化云平臺的工程師小宇,今天我來給大家分享怎樣用BioLadder畫出常用的韋恩圖

如果您反饋問題,報(bào)告Bug,提出新的需求,請直接在公眾號內(nèi)發(fā)留言給我哦!為感謝您對BioLadder的認(rèn)可我們還有星爸爸同款收納包相贈哦!小宇先謝謝大家嘍!

1.什么是韋恩圖?

維恩圖:也叫文氏圖,用于顯示元素集合重疊區(qū)域的圖示。維恩圖既可以表示一個(gè)獨(dú)立的集合,也可以表示集合與集合之間的相互關(guān)系。?一般個(gè)數(shù)在2到7組之間。

用BioLadder云平臺畫韋恩圖

2.繪圖前的數(shù)據(jù)準(zhǔn)備

demo數(shù)據(jù)可以在

https://www.bioladder.cn/shiny/zyp/bioladder2/demoData/Venn/Venn.rar下載。

該模塊支持2種數(shù)據(jù)格式,下面是詳細(xì)介紹

2.1?韋恩圖常用數(shù)據(jù)格式?

第一行為組名,必須要有,會出現(xiàn)在圖中。每一列都是一個(gè)分組。

2.2?定量矩陣表格式

每行是一個(gè)基因,每列是個(gè)樣本。行名和列名都要有,數(shù)值是定量值。

3.BioLadder生信云平臺在線繪制韋恩圖

不想寫代碼?可以用BioLadder生信云平臺在線繪制韋恩圖。

免費(fèi)使用,登錄后暢享50+模塊

網(wǎng)址:https://www.bioladder.cn/web/#/chart/17

3.1?導(dǎo)入數(shù)據(jù)

3.1.1?上傳文件

選擇輸入文件的類型,是常規(guī)格式還是定量矩陣表

點(diǎn)擊“選擇”按鈕上傳自己的文件,支持txt,csv,xlsx,xls四種格式

3.1.2?手動輸入數(shù)據(jù)

在輸入框內(nèi)輸入您的數(shù)據(jù)。上方小面板輸入分組名稱,下方大面板對應(yīng)分組里的具體內(nèi)容。

3.2?調(diào)整參數(shù)

根據(jù)需求調(diào)整參數(shù)即可

??顏色透明度:調(diào)整圖案顏色的透明度

??數(shù)字大?。赫{(diào)整圖中數(shù)字標(biāo)簽的字體大小

??組名字體大小:?調(diào)整圖中組名字體的大小

??是否自定義顏色:勾選后可在下方的顏色選擇器中挑選自己喜歡的顏色

3.3?提交查看

上傳完數(shù)據(jù),并調(diào)好參數(shù)后,點(diǎn)擊右上方“提交”按鈕,圖像會出現(xiàn)在左側(cè)。如果沒有上傳自己的數(shù)據(jù),會使用默認(rèn)的demo數(shù)據(jù)繪圖。

3.4?下載

首先,挑選自己想要的格式有png,jpg和pdf供選擇,接著調(diào)整圖片的寬,高和分辨率(注:這里的寬高比會反饋到左上的繪圖區(qū)),最后點(diǎn)擊“Download”下載按鈕。

4.?韋恩圖結(jié)果解讀

如圖,有三個(gè)數(shù)據(jù)集。圖案交叉的地方的數(shù)值表示數(shù)據(jù)集數(shù)據(jù)相交的個(gè)數(shù)。圖案未交叉的地方的數(shù)值表示數(shù)據(jù)集數(shù)據(jù)特有的個(gè)數(shù)。

5.BioLadder云平臺

網(wǎng)址:https://www.bioladder.cn/

BioLadder目前上線了生物學(xué)分析最常用的50多個(gè)模塊,主要包括以下四類:

數(shù)據(jù)可視化:箱線圖,南丁格爾玫瑰圖,韋恩圖,UpSet圖,餅圖,詞云圖,核密度圖,小提琴圖,弦圖,柱形圖等

組學(xué)數(shù)據(jù)分析:序列的多重比對,表達(dá)數(shù)據(jù)的CV曲線圖,PCA,T-SNE,熱圖,相關(guān)性熱圖等,趨勢分析的mFuzz,差異分析的火山圖,富集分析的氣泡圖,修飾位點(diǎn)上下游模體分析的seqLogo,Motif熱圖等

功能分析GO弦圖,相互作用網(wǎng)絡(luò)圖,富集分析

數(shù)據(jù)預(yù)處理:歸一化,補(bǔ)值,F(xiàn)DR校正,長寬表互換等

好了韋恩圖的繪制就到這里了,后續(xù)大家想要了解什么內(nèi)容可以給我們評論反饋,我們會根據(jù)大家的意見持續(xù)更新。我們歡迎您以任何方式提出您的優(yōu)化意見,使BioLadder平臺成為廣大科研工作者的生物信息分析首選平臺!

青蓮百奧可提供一站式蛋白質(zhì)組學(xué)、代謝組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、多組學(xué)聯(lián)合分析等科研服務(wù)。青蓮百奧在整體實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)方面經(jīng)驗(yàn)豐富,界內(nèi)最全的Bioactive Database、NeuroPedia Database,專業(yè)分析軟件Peaks,海歸坐鎮(zhèn)生信分析團(tuán)隊(duì),助您在科研道路上乘風(fēng)破浪,沖擊高水平文章。

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