LC-MS和GC-MS技術(shù)是目前代謝組學(xué)研究常用的兩大技術(shù)平臺，但使用單一平臺物質(zhì)檢測的范圍和種類，都有一定的偏向性和局限性。為了解決這個問題，提出LC-MS+GC-MS聯(lián)合組合式雙平臺，可以大大提升代謝組學(xué)檢測的覆蓋度，獲取更加全面的代謝物及其豐度信息。

GC-MS&LC-MS雙平臺從實(shí)驗(yàn)過程到代謝物質(zhì)譜數(shù)據(jù)庫以及項(xiàng)目報告進(jìn)行了全面的升級。

升級一

實(shí)驗(yàn)升級，多維質(zhì)控保障數(shù)據(jù)質(zhì)量

6大質(zhì)控為高質(zhì)量數(shù)據(jù)保駕護(hù)航：

升級二

數(shù)據(jù)庫升級，助力雙平臺精準(zhǔn)分析

雙平臺數(shù)據(jù)庫4大升級看點(diǎn)：

（1）數(shù)據(jù)庫容量大升級，無論是標(biāo)準(zhǔn)品的數(shù)量還是總量較前一版本均有大幅度提升。

a、具有自主知識產(chǎn)權(quán)的GC-MS數(shù)據(jù)庫—LUG 4.0（Untarget database of GC-MS from Lumingbio，Version 4.0），專利號：ZL202010401911.0，標(biāo)準(zhǔn)品庫容量在原有的基礎(chǔ)上補(bǔ)充至1500個，總庫容量增加至3000個；

b、LC-MS數(shù)據(jù)庫—EMDB數(shù)據(jù)庫是專門針對人、動物內(nèi)源性代謝物建立的專屬質(zhì)譜數(shù)據(jù)庫，包含標(biāo)準(zhǔn)品數(shù)據(jù)庫和人工校對數(shù)據(jù)庫。標(biāo)準(zhǔn)品庫容量在原有的基礎(chǔ)上擴(kuò)充至2500個，總庫容量增加至10000個。

圖1 | 鹿明生物自建庫（LUG庫和EMDB庫）升級情況

C、此外，針對商業(yè)及其他公共庫已于近日新METLIN數(shù)據(jù)庫（METLIN 2019 MS/MS Library for Progenesis QI），其包含85,000個代謝物標(biāo)準(zhǔn)MS/MS圖譜。相較該數(shù)據(jù)庫以前的版本，代謝物數(shù)據(jù)多6倍。另外HMDB已升級至5.0，目前庫容217920種代謝物，涵蓋含有132335種代謝途徑。

（2）搜庫方式升級：自建庫中所有代謝物均包含保留時間信息，搜庫采用保留時間+標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)譜圖匹配（代謝物鑒定金標(biāo)準(zhǔn)），定性更準(zhǔn)確；
?百萬立項(xiàng)計劃 | 代謝組學(xué)鑒定新?lián)ψC-代謝物鑒定金標(biāo)準(zhǔn)

圖2 |?不同數(shù)據(jù)庫搜庫匹配實(shí)例

（注：上圖為通過不同數(shù)據(jù)庫及不同搜庫方式得到的定性結(jié)果，通過實(shí)際的匹配情況及得分情況，可以發(fā)現(xiàn)通過保留時間及標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)譜圖匹配可靠性高）

（3）代謝物信息更豐富：提供保留時間、一級精確質(zhì)量信息、二級質(zhì)譜碎片信息、代謝物分類信息、分子量、分子式、CAS號、主流數(shù)據(jù)庫ID編號（HMDB編號、METLIN編號、LIPIDMAPS編號、Pubchem編號）、KEGG號、InChIKey，方便研究者對代謝物進(jìn)行信息溯源。

（4）聚焦功能代謝組：LUG4.0和EMDB2.0全面覆蓋糖酵解/糖異生、TCA循環(huán)、苯丙氨酸代謝、色氨酸代謝、類固醇生物合成、類固醇激素生物合成、初級膽汁酸生物合成、甘油磷脂代謝等幾十余條重要代謝通路。

圖3 |?部分重要通路標(biāo)準(zhǔn)品覆蓋情況

升級三

報告升級，分析內(nèi)容更豐富

新版報告新增了代謝物的分類情況統(tǒng)計、差異代謝物箱型圖、聯(lián)合分析相關(guān)性網(wǎng)絡(luò)圖等。

代謝物定性數(shù)據(jù)矩陣信息更豐富：

• 新增定性等級，方便研究者了解哪些代謝物是通過標(biāo)準(zhǔn)品自建庫注釋，哪些是通過其他庫注釋；

• 新增當(dāng)前主流數(shù)據(jù)庫對應(yīng)ID，方便研究者信息溯源。

  
  

圖4 | 定性數(shù)據(jù)矩陣實(shí)例

本次數(shù)據(jù)庫的將大大提升精準(zhǔn)分析的準(zhǔn)確度，為助力GC-MS/LC-MS雙平臺代謝組學(xué)、非靶向代謝組學(xué)、靶向代謝組學(xué)、功能代謝組學(xué)研究

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