本文將通過一個實例向大家介紹如何利用gephi繪制網(wǎng)絡(luò)圖。

Ⅰ

Gephi下載及安裝

Gephi安裝要求

① gephi是一個可多平臺使用的繪圖軟件，能在Windows，OS，Linux上使用，它是基于java開發(fā)的，所以安裝gephi之前，你的電腦需要安裝7.0以上的java版本；

② 硬件要求500 MHz CPU + 128 MB RAM + OpenGL 1.2，并且隨網(wǎng)絡(luò)圖的大小對內(nèi)存的要求有所不同。

Gephi特點

① 得益于內(nèi)置的OpenGL引擎支持，用戶可以使用Gephi對大圖進行交互有效的操作。

可視化多達一百萬個元素的網(wǎng)絡(luò)。所有操作（例如布局、篩選、拖動）都實時運行。擁有大量的圖形控制工具。

② 安裝使用簡單方便。

以可視化為中心的 UI，如 Photoshop 的圖形處理。

③ 支持Gephi模塊化擴展和插件開發(fā)。

該架構(gòu)建立在 Netbeans 平臺之上，可以通過精心編寫的 API 輕松擴展或重用。

Ⅱ

Gephi操作

軟件地址：https://xtynj.top/0872.html?id=A43eXWRUcCV8N6oq

1

導(dǎo)入文件

Gephi支持多種數(shù)據(jù)類型的導(dǎo)入，今天的例子介紹的是常用的csv類型。

在Data Laboratory 選擇Import Spreadsheet，設(shè)置好要輸入的文件位置后，選擇是點文件nodes table 還是邊文件edges table，然后點擊next。

下一步，設(shè)置輸入文件各列的數(shù)據(jù)格式，設(shè)置好之后點擊finish即可完成點文件的輸入，同樣的方法可以導(dǎo)入邊文件。

值得注意的是，點文件和邊文件有幾列需要固定格式和名稱。點文件的第一列是點的ID，否則會自動設(shè)置為1，2，3...；第二列是Label，即在圖中顯示的點標(biāo)簽名，這兩列的數(shù)據(jù)類型自動設(shè)置為字符串（string）。邊文件的前兩列為Source和Target，即邊連線的兩端點。

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得到初步圖形

數(shù)據(jù)導(dǎo)入之后，切換到Overview界面，可以看到下面的圖形。

是不是密集恐懼癥要犯了？別怕，盛世美圖是要一步一步練就出來的，請務(wù)必撐到最后！

右側(cè)的context部分統(tǒng)計了點和邊的數(shù)量。

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美化網(wǎng)絡(luò)圖

點的顏色

左側(cè)Appearance對點和邊進行設(shè)置。下面是根據(jù)點文件中的class列對點進行分組，根據(jù)不同的分組設(shè)置顏色，palette可選擇不同的顏色設(shè)置方案，點擊apply應(yīng)用該設(shè)置。

點的大小

同樣，根據(jù)邊文件中的log列設(shè)置點的大小，點擊apply應(yīng)用該設(shè)置。

邊的顏色

根據(jù)邊文件中的連續(xù)變量設(shè)置有顏色梯度的邊，或者根據(jù)離散型變量設(shè)置離散的邊顏色。

布局

經(jīng)過邊和點的設(shè)置之后，圖形已經(jīng)好看了不少，但是仍然是散亂的一團。Gephi中提供了多種網(wǎng)絡(luò)圖的布局算法，通過設(shè)置可以使點和邊的排列更有規(guī)律也更能反映網(wǎng)絡(luò)圖內(nèi)部的一些規(guī)律。

除了可視化網(wǎng)絡(luò)關(guān)系，gephi還可以對各種圖形指數(shù)進行統(tǒng)計計算，點擊右側(cè)statistics可以看到許多指數(shù)，點擊run即可獲得你想要的指數(shù)結(jié)果。

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導(dǎo)出

最后，就是將我們完成的圖片進行導(dǎo)出。點擊切換到preview界面，在此界面依然可以對圖形進行設(shè)置，包括是否顯示點標(biāo)簽、標(biāo)簽字體及大小、是否顯示邊、顏色及彎曲度等等，設(shè)置好之后點擊refresh進行圖形更新，點擊export導(dǎo)出圖形。