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基因敲除細(xì)胞,紅棉一鍵評估實驗風(fēng)險——源井生物

2023-05-25 13:47 作者:源井生物  | 我要投稿


? ? ? ? 隨著組學(xué)技術(shù)的發(fā)展,越來越多的未知功能基因和新基因被發(fā)現(xiàn),想要了解基因在細(xì)胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、基因表達調(diào)控或結(jié)構(gòu)組成中的作用,CRISPR基因敲除技術(shù)是最直接的手段,然而基因敲除實驗“牽一發(fā)而動全身”,您是否在實驗過程中經(jīng)常碰壁?目的基因能不能“敲”?在野生型細(xì)胞系中的表達量如何?能否成功拿到KO純合子?諸多因素都影響著實驗時間和成本。源井生物基于3000萬CRISPR文庫海量敲除數(shù)據(jù)和?3500+KO項目建庫數(shù)據(jù),獨家研發(fā)出CRISPR紅棉基因編輯系統(tǒng),1min全自動交付基因敲除方案,現(xiàn)在基因風(fēng)險評估、基因表達量評估、基因拷貝數(shù)評估三大模塊全新上線,幫您有效甄別“危險”基因,定制方案,錦上添花,1min交付評估結(jié)果。

目的基因能不能“動”?紅棉【基因風(fēng)險評估系統(tǒng)】即可查詢

? ? ? ? 有些基因?qū)?xì)胞至關(guān)重要,基因敲除后會導(dǎo)致細(xì)胞死亡,若您動了細(xì)胞生長的“必須基因”,會難以拿到KO純合克隆,基因風(fēng)險評估系統(tǒng)基于3000萬CRISPR文庫敲除數(shù)據(jù),涵蓋1400+細(xì)胞,展示該基因在細(xì)胞中敲除的風(fēng)險概率,精準(zhǔn)辨別致死基因,讓實驗安全有保障。

目的基因在細(xì)胞中“表達量”如何?來【基因表達量評估系統(tǒng)】告訴您

? ? ? ?千辛萬苦敲除DNA,實驗接近尾聲時,卻發(fā)現(xiàn)基因在野生型細(xì)胞中本就不表達,白白辛苦一場,因此在實驗開展前了解目的基因在細(xì)胞中的表達情況十分必要,本系統(tǒng)涵蓋1400+細(xì)胞的RNA-seq數(shù)據(jù),根據(jù)TPM值劃分表達量,用于指導(dǎo)細(xì)胞基因編輯項目開展的價值,讓基因編輯有價值。

敲除實驗無法獲得純合子?【基因拷貝數(shù)評估系統(tǒng)】給您答案

? ? ? ? 基因不致死但是難以拿到純合子細(xì)胞,原來是選的細(xì)胞核型太復(fù)雜,基因拷貝數(shù)太高!本系統(tǒng)基于1000種細(xì)胞的基因組測序結(jié)果,結(jié)合核型分析數(shù)據(jù),智能計算基因拷貝數(shù),選擇最佳細(xì)胞輕松獲得純合子!拷貝數(shù)越低,獲得純合子概率越高。

? ? ? ? 紅棉系統(tǒng)小工具使用方法簡便,僅需輸入基因名、細(xì)胞名和組織來源,一鍵提交即可獲得評估結(jié)果

? ? ? ? 評估后發(fā)現(xiàn)目的基因/細(xì)胞系不適用于您的實驗,沒關(guān)系,我們小工具會展示基因在組織和所有細(xì)胞中的表達量,您可根據(jù)評估情況合理選擇,省去再去查找文獻的時間。

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