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各位小伙伴大家好，小果和大家又見面了，前面呢小果有分享果關(guān)于轉(zhuǎn)錄因子的一些數(shù)據(jù)庫，但是都是僅僅提到了一些，今天呢小果來和大家聊一聊預(yù)測轉(zhuǎn)錄因子DNA結(jié)合蛋白結(jié)合識別位點(diǎn)的JASPAR數(shù)據(jù)庫。小果下面的內(nèi)容從以下方面展開：一是JASPAR數(shù)據(jù)庫概況，二是簡單使用JASPAR數(shù)據(jù)庫。

數(shù)據(jù)庫概況

JASPAR數(shù)據(jù)庫是可預(yù)測轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)，網(wǎng)址為：https://jaspar.genereg.net，小伙伴們點(diǎn)擊進(jìn)入之后網(wǎng)站首頁是下面的樣子。

JASPAR是一個(gè)開放獲取數(shù)據(jù)庫，其中包含精選的非冗余轉(zhuǎn)錄因子（TF）結(jié)合配置文件，存儲為六個(gè)分類組中多個(gè)物種的TF的位置頻率矩陣（PFM）和TF模型（TFFM）。在第9個(gè)版本中，擴(kuò)展了CORE系列，增加了341個(gè)新配置文件（植物148個(gè)，脊椎動物101個(gè)，尿酸鹽85個(gè)，昆蟲7個(gè)），比上一個(gè)版本的擴(kuò)展了19%。新版的JASPAR數(shù)據(jù)庫中提供了一種新工具，用于在用戶提供的基因組區(qū)域進(jìn)行JASPAR TFBS濃縮分析。

數(shù)據(jù)庫使用

小果在這里以查找tp53基因的轉(zhuǎn)錄因子為例進(jìn)行簡單介紹，在進(jìn)入到JASPAR數(shù)據(jù)庫首頁，小伙伴可以發(fā)現(xiàn)有一個(gè)Search按鈕，在搜索框輸入tp53基因，點(diǎn)擊search進(jìn)行查找。

Search后得到結(jié)果頁面如下，可以看到查詢到的信息比較多，得到了數(shù)據(jù)ID，名稱，物種，組，家族和logo，小伙伴可以選擇自己想要的ID進(jìn)行查看。

點(diǎn)擊后就可以進(jìn)入對應(yīng)的頁面，可以看到有文件概況、序列l(wèi)ogo圖、PFM矩陣（文件可下載）、和其它信息。如下所示：

至此呢，小果對于JASPAR數(shù)據(jù)庫的介紹就到這里了，小伙伴們快去小試牛刀，看看自己有沒有學(xué)到精髓。

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