穩(wěn)轉(zhuǎn)建系藥篩細節(jié)盤點,你不清楚的細節(jié)都在這~
穩(wěn)轉(zhuǎn)建系,是很多基因功能研究繞不過的實驗。常見穩(wěn)轉(zhuǎn)株的兩種篩選方式:流式分選和抗性藥物篩選。流式分選依賴流式細胞儀,所以藥篩是不少實驗萌新的首要選擇。然而,在勤勤懇懇選好轉(zhuǎn)染工具,好不容易得到較好轉(zhuǎn)染效率的陽性細胞后,因為后面的藥篩細節(jié)不到位,導(dǎo)致結(jié)果差強人意的不在少數(shù)。到底是哪里出了問題呢?漢恒小編為大家整理了一篇詳細的藥篩Protocal,供大家參考。
1、常用的藥篩抗生素種類及溶解保存:
嘌呤霉素(Puromycin);新霉素/G418(Neomycin);殺稻瘟菌素(Blasticidin);潮霉素B(HygromycinB);博來霉素(Zeocin/bleomycin)。
①以水為溶劑的抗生素貯存液應(yīng)使用0.22um濾器過濾除菌;②用乙醇溶解的抗生素溶液無須過濾除菌;③所有抗生素貯液都應(yīng)避光保存;④抗生素配置完成后,都需要分裝成小份,方便取用,避免反復(fù)凍融。
2、殺死曲線(kill curve)建立
抗生素的有效篩選濃度與細胞類型、生長狀態(tài)、細胞密度、細胞代謝情況及細胞所處周期等有關(guān),確定抗生素殺死未轉(zhuǎn)染細胞的最低工作濃度至關(guān)重要。下面以嘌呤霉素為例:
Day1:準備24孔板,鋪板目的細胞,第二天細胞匯合度應(yīng)在50%~60%;
Day2:加入不同濃度梯度的嘌呤霉素,同時設(shè)置不加嘌呤霉素的對照組細胞,分別設(shè)置3個平行,排除其余干擾因素。具體梯度設(shè)置可以參考相關(guān)文獻,或直接設(shè)置幾個梯度,如:0.5、1.0、2.0、4.0、6.0、8.0、10.0μg/mL;
Day3-4:每隔一天更換含嘌呤霉素的培養(yǎng)基,嘌呤霉素的篩選至少需要48 h(一般能殺死90%以上的細胞),有效濃度嘌呤霉素的篩選周期一般在2~10天。
制作殺死曲線,選取48h內(nèi)可殺死90%細胞的最低濃度作為后續(xù)穩(wěn)轉(zhuǎn)株篩選工作濃度。
3、穩(wěn)轉(zhuǎn)株篩選
Day1:細胞轉(zhuǎn)染攜帶抗性基因的質(zhì)粒/病毒48-72h后,在細胞匯合度在60%~70%時(細胞太密可先行傳代,等待細胞貼壁再繼續(xù)后面的篩選),在培養(yǎng)基中加入上述確定的工作濃度抗生素,同時設(shè)置空白細胞對照組(未轉(zhuǎn)染質(zhì)?;虿《镜龋?;
Day2-3:篩選至少48h,當(dāng)空細胞加抗生素組死亡率>90%,將含藥篩抗生素培養(yǎng)基撤換為新鮮完全培養(yǎng)基,此時實驗組剩下的基本可以認為是陽性細胞;
Day4~:對篩選的陽性細胞進行繼續(xù)篩選和擴增(隔代加藥維持陽性細胞率,維持濃度為工作濃度的一半,或根據(jù)空白細胞生長速度及細胞狀態(tài)調(diào)整),進行細胞保種與復(fù)檢。
至此即得到了混合克隆穩(wěn)轉(zhuǎn)株。
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