土壤污染可分為無機(jī)污染物和有機(jī)污染物，無機(jī)污染物主要包括酸、堿、重金屬、鹽類等。有機(jī)污染物主要包括有機(jī)農(nóng)藥、酚類、氰化物、石油、合成洗滌劑等。

　　微生物肥料修復(fù)土壤的基本原理是在適宜的條件下(水分、溫度、pH值等。)，肥料中的微生物菌群與土壤中原有的有益微生物形成優(yōu)勢(shì)菌群，促進(jìn)土壤生態(tài)系統(tǒng)中碳、氮、氧等元素的良性循環(huán)，從而修復(fù)土壤生態(tài)環(huán)境系統(tǒng)，使生態(tài)系統(tǒng)達(dá)到新的穩(wěn)定平衡。

　　其中，生物肥對(duì)無機(jī)污染物的生物修復(fù)機(jī)理是生物肥進(jìn)入土壤生態(tài)系統(tǒng)后，好氧菌、厭氧菌等微生物益生菌通過自身的生物反應(yīng)降低土壤酸度，提高土壤 pH 值，從而降低土壤中有害重金屬的毒性;

　　同時(shí)，肥料中的微生物菌可以固定重金屬，促進(jìn)土壤中的活性重金屬有機(jī)結(jié)合，形成過濾層和隔離層，減少作物對(duì)土壤中重金屬的吸收，從而防止土壤中的重金屬等有害物質(zhì)或其分解產(chǎn)物通過“土壤-植物-人體”或“土壤-水-人體”被人體間接吸收，損害健康。

　　生物肥料在對(duì)我國土壤中農(nóng)藥等有機(jī)污染物進(jìn)行修復(fù)技術(shù)方面的作用是可以降低病蟲害的防治工作次數(shù)，降低使用農(nóng)藥的使用量，從而能夠減少農(nóng)藥在作物中的殘留量。

　　首先，微生物肥料能改變耕層土壤微生物群落，在作物根系周圍形成優(yōu)勢(shì)菌群，從而有力地抑制病原菌的繁殖，減少病蟲害的發(fā)生

　　另一方面，微生物在生命活動(dòng)中產(chǎn)生多種物質(zhì)，如激素、腐植酸、抗生素等，可以刺激作物健康生長，增強(qiáng)自身抗病能力。