樹狀圖殘骸篇，時間：九月十四日。

結標淡希登場。本卷的主角其實是白井黑子。又是沒有魔法的一卷。

第一章

黑子和美琴在逛街時，黑子接到風紀委員同事的電話通知有任務做。當麻的宿舍內(nèi)，小茵問當麻天氣預報怎么老是報錯，當麻回答以前是百分百正確但最近演算裝置壞了。【樹狀圖設計者】，學都的一具人造衛(wèi)星，能正確預測地球所有空氣分子動向的超級電腦，已經(jīng)不在了。

第二章

風紀委員活動室第177支部，初春飾利告訴黑子事件是一起搶劫案，十個人搶走了一個人的旅行箱。這案件有不少疑點，根據(jù)監(jiān)控來看，受害者并沒有報案而是用無線電對講機聯(lián)系某人；旅行箱上貼著的發(fā)送單顯示物品為一件機器，目的地是常盤臺的一個單位但是黑子不知道有這個單位；受害者似乎帶著手槍。搶劫犯逃入了地下街，黑子前往抓捕。

搶劫犯們從地鐵出口跑出鉆入一個小巷，黑子運用【空間移動】超能力和體術搶回箱子把這些人擊昏。拍下箱子的照片給初春，初春從發(fā)送單和標識查出這是第二十三學區(qū)的東西，二十三學區(qū)是進行航空與宇宙事業(yè)的學區(qū)，這個箱子也是用航空材料制成的。

箱子突然消失，一個少女坐在箱子上，黑子認為這是空間移動，少女解釋自己的能力是【坐標移動】，不需要觸摸也能移動物體。黑子沖上去，拿出小型金屬箭矢，她的大招是將這些箭矢移動到敵人身上貫穿非要害部位以制服，但是這些箭矢消失了然后貫穿黑子自己的身體，黑子嚴重受傷。少女繼續(xù)說出不少信息，她和這些搶劫犯是一伙的，箱子里的是【樹狀圖設計者】的殘骸，外界不知道但樹狀圖已經(jīng)毀壞了，不少國家在爭奪殘骸。還透露了這東西和御坂美琴有關，八月二十一日，一個對她而言是噩夢的實驗終止了，但一旦樹狀圖的演算能力恢復實驗可能會重啟。少女瞬移走了。

黑子回到宿舍給自己包扎，電話中初春告訴黑子那個少女是結標淡希，和黑子一樣是LV4的空間類型大能力者，但她的超能力比黑子強很多，結標不需要觸碰就能移動物體，移動距離和移動質量也遠超黑子。據(jù)未證實情報，結標還是學都理事長大本營的【領路人】。

黑子外出，初春告訴黑子結標無法連續(xù)移動她自己的身體，她曾因能力失控受重傷，造成心理創(chuàng)傷，如果進行連續(xù)移動精神狀態(tài)會瞬間惡化。遠處傳來震耳欲聾的雷擊聲，然而天空沒有云，黑子立刻想到是美琴在戰(zhàn)斗，向那個方向移動。某棟大樓后面，美琴和三十人對峙，有持槍的人和能力者，結標也在，但在超電磁炮和雷擊的壓倒性力量下這個部隊瓦解了。結標嘲諷美琴是不是害怕樹狀圖被修復實驗重啟，美琴指出結標不能移動自己的弱點，但是結標還是瞬移走了。躲在一旁的黑子決定抓到結標，同為空間能力者她知道逃到哪里才能躲過美琴追擊。

將近一萬名御坂妹妹分散在世界各地，學都內(nèi)的妹妹不足十人，她們通過御坂網(wǎng)絡相互聯(lián)系。妹妹們搜集到情報：許多國家回收了【樹狀圖設計者】的碎片，但只有學都的殘骸是可以用來修復的【核心】。御坂10032號跑去當麻家求助。

第三章

結標瞬移到一家餐廳，因為移動自己她的身體強烈不適很惡心。黑子發(fā)動偷襲，用開瓶器和金屬箭矢給結標造成和她一樣的傷口。兩人戰(zhàn)斗，周圍的桌椅餐具都可以作為武器。結標移動了大量桌椅把黑子壓住。結標邊處理傷口邊說出自己的目的：她要得到【殘骸】，修復【樹狀圖設計者】，利用這個超級模擬機器找到是否有人類以外的事物能產(chǎn)生超能力的可能性，為此她不惜和外界組織接觸。她是能力者卻恐懼超能力這過分強大和危險的力量，如果非人類也可以使用超能力為社會做貢獻，他們這些能力者就不需要提心吊膽防止不小心傷害他人被當成怪物了。

黑子對其表示不屑，她可以使用自己的超能力救人，結標這種認為能力者都是危險分子的想法她只認為是懦弱的借口。黑子強撐身體撐開壓在她身上的重物，提著個燈座就沖上來，她的氣勢讓結標感到恐懼，但結標用手槍擊中黑子腹部使她倒下。結標看著流血的黑子，意識到和超能力無關，她也是個會傷害他人的人，這使得結標情緒沖動，能力暴走，周圍的物體像被無形旋風卷起漂浮移動。不一會暴走停止，然而結標情緒依舊未穩(wěn)定，她遷怒于黑子，說要殺了黑子，她的極限是移動4520公斤的物體，她會在外面把這整棟建筑都壓扁。

結標離開，周圍空間開始扭曲，黑子認為自己要死了，樓道傳來腳步聲，黑子出聲阻止說馬上這里會受到攻擊。美琴在外面用超電磁炮給大樓打出一個隧道出口，當麻沖了過來一揮拳修正了空間扭曲。黑子問當麻為什么要冒著生命危險來救她。

少年毫不猶豫地答道：

【這個嘛，怕當然是會怕，不過這是承諾。】

【承諾？】白井反問。少年往四周張望了一下，似乎正在確認周圍一個旁人也沒有。接著，少年壓低了聲音悄悄說道：

【.....沒錯，是承諾。這個承諾就是守護御坂美琴與她周遭的世界。這是我跟某個愛出風頭又三分鐘熱度的無名小卒之間的約定?！?/p>

結標獨自走在道路上，無線電另一頭傳來混亂的聲音，學都警衛(wèi)找到外界組織本部并摧毀了。結標想拿著殘骸投靠其他組織，然而拄著拐杖脖子上戴著項圈電極的一方通行攔在她面前，因為小御坂的請求他過來摧毀可能導致實驗重啟的因素。一方通行靠著御坂網(wǎng)絡的計算力能夠自理了，甚至切換能力使用模式還能使用LV5等級的超能力，他上前打爆了殘骸，一拳打昏了結標。