植物染色質(zhì)免疫沉淀分析,小艾教你如何選擇植物ChIP工具?
染色質(zhì)免疫沉淀分析 (ChIP) 是目前確定與特定蛋白結(jié)合的基因組區(qū)域或確定與特定基因組區(qū)域結(jié)合的蛋白質(zhì)的比較好的一種方法。so,我們今天來聊聊染色質(zhì)免疫沉淀分析方法。
染色質(zhì)免疫沉淀法(Chromatin immunoprecipitation,ChIP)是研究體內(nèi)DNA與蛋白質(zhì)相互作用的重要工具。它可以靈敏地檢測目標蛋白與特異DNA丨片段的結(jié)合情況,還可以用來研究組蛋白與基因表達的關(guān)系。
CHIP技術(shù)通過三大步驟實現(xiàn):第1,甲醛固定后染色質(zhì)分離和斷片;第2,運用特異蛋白質(zhì)抗體(CHIP級別),免疫共沉淀結(jié)合蛋白的染色質(zhì)片段;第3,分析目標DNA。
這里我們就要說到CHIP技術(shù)工具之——植物染色質(zhì)免疫沉淀試劑盒了。它的原理是什么呢?不妨以P-2014植物染色質(zhì)免疫沉淀試劑盒來舉個栗子~~
P-2014植物染色質(zhì)免疫沉淀試劑盒旨在通過甲醛交聯(lián)、物理或化學處理細胞核以及染色質(zhì),從而運用特異抗體結(jié)合蛋白進行免疫沉淀,然后萃取DNA,擴增分析,用以確定結(jié)合蛋白的目標DNA。
接下來再說說它的特征,P-2014植物染色質(zhì)免疫沉淀試劑盒涵蓋全套試劑,允許試驗者有效地在體內(nèi)研究蛋白-DNA相互關(guān)系。整個過程可以在6小時內(nèi)完成(哇哦,厲害了~)
當然了,還有相當重要的一點:P-2014植物染色質(zhì)免疫沉淀試劑盒適用于將特異性免疫沉淀與定性和定量PCR、MS-PCR、ChIP-Seq、ChIP-on-chip結(jié)合使用。
歐邁噶!P-2014植物染色質(zhì)免疫沉淀試劑盒包括一個ChIP級二甲基組蛋白H3-K9抗體--陽性對照,以及一個正常小鼠IgG——陰性對照。從染色質(zhì)從樣本中釋放出來后,經(jīng)剪切、斷片,添加到包被了抗體的微孔中,蛋白質(zhì)-DNA復合物經(jīng)特異性抗體捕獲,解交聯(lián)后DNA被釋放,通過離心柱,純化并洗脫目的DNA。洗脫下來的DNA可用于各種下游應用。

接著看看樣本,起始材料可包括各種植物組織(花、葉、幼苗)。在一般情況下,每個反應的樣本量應該是20~50毫克的植物組織。
最后總結(jié)一下,植物染色質(zhì)免疫沉淀分析,首先一定要選對方法,然后就是工具,比如說剛剛分析的植物染色質(zhì)免疫沉淀試劑盒,它需要滿足哪些條件?
1.快速簡單:實驗能在6小時內(nèi)完成;
2.實驗靈活:可手動或高通量;
3.包括DNA純化柱:省時省力;
4.與所有的DNA擴增方法兼容;
5.能達到簡單、可靠和一致的檢測條件
好,今天就先簡單的介紹到這里,有想法的小伙伴可一起參與討論,期待下期更精彩哦~
植物ChIP鏈接:
http://www.amyjet.com/products/P-2014-24.shtml