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利用新一代精準(zhǔn)蛋白質(zhì)組學(xué)進(jìn)行腫瘤學(xué)研究

2023-04-18 15:18 作者:鯨舟基因  | 我要投稿

盡管已有數(shù)十年的基礎(chǔ)研究和基因組技術(shù)的探究,癌癥仍然是全球醫(yī)療資源不堪重負(fù)的負(fù)擔(dān),對科學(xué)界來說也是一個巨大的挑戰(zhàn)。目前,蛋白質(zhì)生物標(biāo)志物越來越多地被視為可行的“液體活檢”技術(shù)手段,可用于更好地了解癌癥生物學(xué)、識別風(fēng)險因素、分層患者群體、提供診斷、預(yù)后和治療反應(yīng)標(biāo)記,并推動新的、更有效的治療方法的開發(fā)。Olink公司的可擴展的、經(jīng)過驗證的多重蛋白質(zhì)生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)和開發(fā)平臺在癌癥研究的幾個關(guān)鍵領(lǐng)域正在產(chǎn)生越來越大的影響。


01. 癌癥的早期檢測

癌癥的早期檢測可以提高生存率,降低治療成本,改善整體患者預(yù)后。正如下面所展示的幾項研究顯示,在臨床癌癥癥狀出現(xiàn)之前,某些特定蛋白標(biāo)志的水平會顯著增加,同時還可以鑒定出能夠準(zhǔn)確診斷早期癌癥的微創(chuàng)血液生物標(biāo)志物。

??Magis et al. (2020) Untargeted longitudinal analysis of a wellness cohort identifies markers of metastatic cancer years prior to diagnosis, Scientific Reports, DOI: 10.1038/s41598-020-73451-z


??Ura et al. (2022) A Targeted Proteomics Approach for Screening Serum Biomarkers Observed in the Early Stage of Type I Endometrial Cancer, Biomedicines, DOI: 10.3390/biomedicines10081857

由Gal-1、Gal-9、MMP7、FASLG和COL9A1組成的組合,能夠在AUC=0.969的情況下診斷早期I期子宮內(nèi)膜癌。


??Thiis-Evensen et al. (2022) Plasma protein biomarkers for the detection of pancreatic neuroendocrine tumours and differentiation from small intestinal neuroendocrine tumours, Journal of Neuroendocrinology, DOI: 10.1111/jne.13176

Olink數(shù)據(jù)在機器學(xué)習(xí)分析鑒定出一個9個蛋白組成的標(biāo)志,可以用于鑒別胰腺神經(jīng)內(nèi)分泌腫瘤(NET)和對照組(AUC=0.99),并區(qū)分胰腺和小腸NET(AUC=0.98)(見下圖)。



02. 療效監(jiān)測


治療干預(yù)在癌癥患者中的結(jié)果可能會有很大的變化,而能夠預(yù)測哪些個體更有可能對特定治療做出反應(yīng)的生物標(biāo)志物將是無價之寶,尤其是在個體化醫(yī)學(xué)的背景下,以指導(dǎo)和優(yōu)先考慮不同的治療選擇。以下最近的研究使用Olink技術(shù)顯示蛋白質(zhì)組學(xué)如何鑒定循環(huán)生物標(biāo)志物以預(yù)測治療結(jié)果。


??Loriot et al. (2021) Plasma proteomics identifies leukemia inhibitory factor (LIF) as a novel predictive biomarker of immune-checkpoint blockade resistance, Annals of Oncology, DOI: 10.1016/j.annonc.2021.08.1748

基線水平低的LIF與接受免疫檢查點抑制劑治療多種癌癥患者的中位總生存時間延長5倍有關(guān)(AUC=0.735)。


??Tang et al. (2023) Multiplex immune profiling reveals the role of serum immune proteomics in predicting response to preoperative chemotherapy of gastric cancer, Cell Reports Medicine, DOI: 10.1016/j.xcrm.2023.10093

基于術(shù)前關(guān)鍵蛋白質(zhì)的血清水平,蛋白質(zhì)組學(xué)將胃癌術(shù)前化療的反應(yīng)者/非反應(yīng)者分層(詳見下圖)?中科普瑞提供Olink蛋白組服務(wù)。




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