ATAT輸入文件lat.in快速生成(基于vasp輸入文件)
經(jīng)驗(yàn)分享
????????本篇推送基于往期準(zhǔn)隨機(jī)模型構(gòu)建教程推送ATAT-mcsqs生成準(zhǔn)隨機(jī)結(jié)構(gòu)(SQS)修改而來。
????????參考讀者意見,意在提供一些特殊結(jié)構(gòu)模型轉(zhuǎn)化為ATAT輸入文件的方式。
首先,準(zhǔn)備原始單一元素(共格的多元素合并為一種)晶胞,并通過vaspkit獲得其最原始晶胞。
例如這里準(zhǔn)備了一個面心立方的結(jié)構(gòu),組分單一,面心和頂角元素相同,這里設(shè)置為Si。

Si? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ?1.00000000000000? ? ?
? ? ?4? ? 0.0000000000000000? ? 0.0000000000000000
? ? ?0.0000000000000000? ?4? ? 0.0000000000000000
? ? ?0.0000000000000000? ? 0.0000000000000000? ? 4
? ?Si
4
Direct
? 0.0000000000000000? 0.0000000000000000? 0.0000000000000000
? 0.0000000000000000? 0.5000000000000000? 0.5000000000000000
? 0.5000000000000000? 0.0000000000000000? 0.5000000000000000
? 0.5000000000000000? 0.5000000000000000? 0.0000000000000000
? 0.0000000000000000? 0.5000000000000000? 0.0000000000000000
通過vaspkit 602功能獲得其原胞
vaspkit -task 602
?
?+---------------------------------------------------------------+
?|? ? ? ? ?VASPKIT Standard Edition 1.3.5 (03 Jul. 2022)? ? ? ? ?|
?|? ? ? ? ? ? Running VASPKIT Under Command-Line Mode? ? ? ? ? ? |
?+---------------------------------------------------------------+
?-->> (01) Reading Structural Parameters from POSCAR File...
?+-------------------------- Summary ----------------------------+
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?Prototype: A
? ? ? ? ? ?Total Atoms in Input Cell:? ?4
? ? ?Lattice Constants in Input Cell:? ?4.000? ?4.000? ?4.000
? ? ? ? Lattice Angles in Input Cell:? 90.000? 90.000? 90.000
? ? ? ?Total Atoms in Primitive Cell:? ?1
?Lattice Constants in Primitive Cell:? ?2.828? ?2.828? ?2.828
? ? Lattice Angles in Primitive Cell:? 60.000? 60.000? 60.000
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? Crystal System: Cubic
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?Crystal Class: m-3m
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?Bravais Lattice: cF
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?Space Group: 225
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?Point Group: 32 [ Oh ]
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?International: Fm-3m
? ? ? ? ? ? ? ? ?Symmetry Operations: 192
?+---------------------------------------------------------------+
?-->> (02) Written PRIMCELL.vasp file.
?+---------------------------------------------------------------+
原胞信息如下,只存在一個wyckoff點(diǎn)位。
Primitive Cell
? 1.000000
? ? 0.00000000000000? ? 2.00000000000000? ? 2.00000000000000
? ? 2.00000000000000? ? 0.00000000000000? ? 2.00000000000000
? ? 2.00000000000000? ? 2.00000000000000? ? 0.00000000000000
? Si
? ?1
DIRECT
? ? 0.0000000000000000? ? 0.0000000000000000? ? 0.0000000000000000? ? Si1

將vaspkit生成的原胞文件PRIMCELL.vasp復(fù)制為POSCAR,然后通過vaspkit?的414功能將POSCAR轉(zhuǎn)化為ATAT的輸入文件lat.in

vaspkit -task 414
?
?+---------------------------------------------------------------+
?|? ? ? ? ?VASPKIT Standard Edition 1.3.5 (03 Jul. 2022)? ? ? ? ?|
?|? ? ? ? ? ? Running VASPKIT Under Command-Line Mode? ? ? ? ? ? |
?+---------------------------------------------------------------+
?-->> (01) Reading Structural Parameters from POSCAR File...
?-->> (02) Written lat.in File!
?+---------------------------------------------------------------+
lat.in文件內(nèi)容如下

愿有所成
IEchoQ
引喻失義? ?妄自菲薄