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基因編輯大腸桿菌-效率提高20倍的新技術(shù)

2020-03-30 11:13 作者:源井生物  | 我要投稿

基因編輯細菌

?Red/ET重組系統(tǒng)是微生物基因編輯最經(jīng)典的方法,可以實現(xiàn)對DNA分子的敲除、點突變、敲入等多種修飾。該技術(shù)已被廣泛地用于基因組DNA,如細菌人工染色體、大腸桿菌染色體等的遺傳修飾研究以及基因工程藥物的研究和開發(fā)中。但如何提高基因重組和編輯效率,一直是微生物基因編輯的研究熱點,直到CRISPR/Cas9技術(shù)的出現(xiàn),給微生物基因編輯帶來一線曙光。

CRISPR/Cas9是細菌和古細菌在長期演化過程中形成的一種適應性免疫防御,可用來對抗入侵的病毒及外源DNA。近些年,由于CRISPR-Cas9基因編輯技術(shù)操作簡單,基因編輯效率高被廣泛應用,是目前用于基因編輯最前沿的方法。

CRISPR-B?是源井生物在基于Red/ET重組系統(tǒng)和CRISPR/Cas9基因編輯系統(tǒng)基礎上,通過自主研發(fā)優(yōu)化基因編輯載體和基因編輯流程,在基因編輯效率和準確性均遠高于傳統(tǒng)方法的一項創(chuàng)新性技術(shù)。該技術(shù)可以廣泛應用于細菌和真菌的基因編輯。


CRISPR-B?技術(shù)優(yōu)勢


基因編輯細菌

基因編輯細菌:源井生物利用CRISPR-B?技術(shù)通過電轉(zhuǎn)的方法將CRISPR-B?系列載體導入細菌中,對細菌進行基因編輯,可實現(xiàn)細菌的敲除,點突變或敲入。

傳統(tǒng)的基因敲除技術(shù)存在后期篩選工作量大(周期),重組效率低,殘留loxP或FRT位點等缺點。CRISPR-B?技術(shù)作為一種高效的基因組編輯技術(shù),具有操作簡單、靶向性強、脫靶率低、無痕等諸多優(yōu)勢。


CRISPR-B?技術(shù)可編輯的細菌(節(jié)選):

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技術(shù)流程

1. 構(gòu)建 CRISPR-B?細菌系列載體


2. 電轉(zhuǎn)及制備穩(wěn)轉(zhuǎn)CRISPR-B _CR的感受態(tài)

·CRISPR-B _CR電轉(zhuǎn)到細菌中,菌落PCR鑒定CRISPR-B _CR是否成功轉(zhuǎn)入。

·并將成功轉(zhuǎn)入CRISPR-B _CR的菌株再制成電轉(zhuǎn)感受態(tài)細胞。


3. 導入CRISPR-B_G及CRISPR-B _D進行打靶

將打靶載體CRISPR-B_G及CRISPR-B _D修復模板電轉(zhuǎn)進穩(wěn)轉(zhuǎn)CRISPR-B _CR的感受態(tài)菌株中,CRISPR系統(tǒng)與Red重組系統(tǒng)共同作用對細菌基因組進行編輯。


4. 挑取單克隆進行PCR及測序鑒定,將CRISPR-B?質(zhì)粒消去,獲得敲除陽性克隆菌株。


質(zhì)量控制標準

1. 菌落PCR鑒定 ??? 2.靶位點測序鑒定


注明 | 文章是源井生物原創(chuàng),轉(zhuǎn)載請注明。

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